2015-10-16 1 views
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J'ai utilisé UCS blat pour rechercher une séquence génomique de cheval. Trois résultats ont été retournés, deux étaient des échafaudages non placés, et l'autre était chr1. Tous avaient 100% d'identité à ma requête (gagttcctagacaccaaatacaacgtgggaatacacaacctactggcctatgtgaaacacctgaaaggccagaatgaggaagccctgaagagcttgagagaagctgaagacttaatccaggaagaacatggtgaccaatcaggcat). Ma question est, y a-t-il 3 copies de ce gène dans le cheval, ou les échafaudages peuvent-ils appartenir à chr1? Pour ce que cela vaut, il n'y a qu'une seule copie du gène chez la souris.Les échafaudages génomiques non placés sont-ils uniques par rapport aux chromosomes actuels?

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Je vote pour clore cette question hors-sujet car elle concerne le codage d'ADN et n'a absolument rien à voir avec l'informatique. –

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La réponse se révèle être tous les 3 résultats sont des endroits uniques dans le génome. Les échafaudages non placés sont des séquences du génome sur lesquelles on travaille mais qui n'ont pas été ajoutées au génome de référence.