dna-sequence

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bord correct Recombinaison Répartiteur pour l'assemblage d'ADN

Je suis en train de mettre en oeuvre un algorithme génétique pour assembler des fragments d'ADN dans une séquence donnée uniquement le spectre. Mon seul opérateur est Edge Recombination et j'étais con

python bioinformatics dna-sequence 2017-06-05

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En utilisant la représentation du jeu de chaos pour les séquences de gènes [programme Python]

je dois représenter de nombreuses séquences de gènes en utilisant la représentation du jeu chaos Je suis arrivé ce code python du blog de Boštjan Cigan (https://bostjan-cigan.com/chaos-game-representa

python dna-sequence representation chaos 2017-06-12

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Somme des éléments de la sous-chaîne après les avoir augmentés en deux sous la forme de

Disons que nous avons une fonction. La fonction recive une chaîne en tant que paramètre. La fonction est l'une des fonctions d'une classe. Après avoir récité une chaîne, il calcule certaines variables

python dictionary lambda increment dna-sequence 2017-06-18

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Trouver tous les répétées 4-mères dans une séquence d'ADN - Perl

Bonjour, J'essaie d'écrire un programme qui lit dans un fichier au format FASTA contenant des séquences d'ADN multiples, identifie tous les répétées 4-mères (c.-à-tout 4-mères qui se produisent plus d

regex perl fasta dna-sequence 2017-06-28

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Vérifier si la chaîne d'entrée de l'utilisateur ne contient que des majuscules et/ou des minuscules (JavaScript)

Je crée une extension chrome qui convertit une séquence de nucléotides en leurs acides aminés correspondants, et je rencontre des problèmes avec la validation des entrées utilisateur . Je tiens en fin

javascript google-chrome google-chrome-extension dna-sequence 2017-05-09

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Comparez deux séquences

J'ai du mal à apprendre Python 3 et maintenant je me bats avec cet exercice. j'écrire une fonction qui prend deux arguments: 1) Une chaîne qui est une séquence d'ADN. 2) Une chaîne de même longueur co

python dna-sequence 2017-10-07

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exec() ne pas retourner l'ID de processus

J'utilise la fonction PHP exec() pour exécuter les programmes Canu assembler, et je veux obtenir son ID de processus dans le même script. Le problème est exec() ne renvoyant aucun PID, même si le proc

php exec bioinformatics pid dna-sequence 2017-03-25

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transcription de l'adn supérieure avec pour boucle

Ceci est le code que j'ai pour atteindre mon objectif comme indiqué dans le titre. Le problème que je semble avoir maintenant est la deuxième ligne de code. Au moment où je l'ai ajouté, le programme a

python python-3.x for-loop dna-sequence 2017-10-16

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en comptant le non. de sous-chaînes dans un mot en python

counter=0 i=0 dna_string = "CGATATATCCATAG" if dna_string[i:i+len("ATA")]=="ATA": counter=counter+1 print (counter) 0 J'essaie de compter le non. d'occurrences de "ATA" dans le dna_string

python string substring dna-sequence 2017-02-17

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Je suis en train d'inverser le complément d'une séquence d'ADN de fasta

J'ai essayé d'inverser le complément d'une séquence d'ADN de fasta. Voici mon code: fastafile=open('sequence (3).fasta','r') entries=[] reverse="" sequence=['A','T','G','C','N'] for line in fastaf

python reverse fasta dna-sequence complement 2017-02-19

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