Je suis nouveau à ImageJ, et je veux poser des questions sur comment puis-je par exemple sélectionner et étiqueter la région d'intérêt (par exemple, premier plan) avec 1, et les autres parties de l'image (arrière-plan) avec 0?Étiquetage dans ImageJ
Merci.
L'utilisation de Édition> Sélection> Créer un masque crée un binary image à partir de votre sélection. Dans ImageJ, une image binaire n'a que deux valeurs, 255 (premier plan) et 0 (arrière-plan). Selon vos paramètres dans Process > Binary > Options..., ils sont affichés en noir sur blanc ou en blanc sur noir, respectivement.
Le flux de travail typique dans ImageJ est d'abord prétraiter votre image de premier plan distinct de fond, puis seuil pour créer un masque d'image binaire. Vous pouvez éventuellement effectuer des opérations morphologiques pour manipuler le masque. Ensuite, lorsque vous avez terminé, convertissez le masque en une sélection, transférez la sélection à votre image originale non traitée et mesurez les statistiques souhaitées. Le plug-in "Trainable Weka Segmentation", qui utilise l'apprentissage automatique avec une interface utilisateur intuitive pour classer les pixels de l'image en plusieurs classes, est une autre bonne option pour la segmentation si vous avez du mal à trouver des étapes de prétraitement efficaces.
Pour plus de détails sur ces approches, voir le Segmentation page du wiki Fidji.
Pour étiqueter des objets au premier plan, vous pouvez utiliser Analyze -> Analayze particles et cochez la case "add to Manager" pour la sélection automatique de vos ROI.