R fonction de tri de colonne par longueur de chaîne puis par alphabet?

Question

Je voudrais trier une colonne dans ma trame de données par longueur de la chaîne d'abord, puis par ordre alphabétique, j'ai essayé le code ci-dessous:

#sort column by string length then alphabet 
GSN[order(nchar(GSN[,3]),GSN[,3]),] 

Mais je suis erreur

Error in nchar(GSN[, 3]) : 'nchar()' requires a character vector 

Mes données ressemble:

Flowcell Lane barcode   sample   plate row column 
314  NA NA AACAGACATT LD06_7620SDS GSN1_Hind384D B  4 
307  NA NA AACAGCACT LG10_2688SDS GSN1_Hind384D C  3 
289  NA NA  AACCTC U09_105007SDS GSN1_Hind384D A  1 
232  NA NA AACGACCACC   13_232 GSN1_Hind384C H  5 
10  NA NA AACGCACATT   13_10 GSN1_Hind384A B  2 
165  NA NA  AACGG   13_165 GSN1_Hind384B E  9 

Je voudrais trier la colonne "code à barres". Merci pour votre temps.

Answer 1

Vous pouvez ajouter une autre colonne à votre bloc de données qui contient le nombre de caractères dans le code à barres, puis trier de la manière habituelle.

GSN <- transform(GSN, n=nchar(as.character(barcode))) 

GSN[with(GSN, order(n, barcode)), ] 

Il semble que le problème que vous rencontrez est parce que R pense que barcode est un facteur plutôt qu'un vecteur de caractère, donc nchar() est invalide. Le convertir en caractère via as.character() résout cela.