Alignement de séquence multiple

Question

Je sais que cela peut sembler étrange mais je me demandais si quelqu'un avait déjà vu du code javascript pour le multiple sequence alignment problem. Si ce n'est pas (comme je le suppose) aussi code facilement portable (c'est-à-dire que je n'ai pas besoin d'un évier) fera l'affaire. Gardez à l'esprit que je ne vais pas aligner plus de 4-5 séquences de moins de 100-200 symboles.

Note: Je sais que javascript n'est pas vraiment le meilleur choix pour ce genre de choses. Croyez-moi, il y a une bonne raison pour laquelle je dois le faire en javascript.

Answer 1

La chose la plus proche, j'ai trouvé est juste un pairwise sequence alignment algorithm. Je l'ai transformé en quelque chose qui ferait MSA mais c'est définitivement trop lent pour être utilisable pour plus de cent symboles.

Answer 2

http://biostar.stackexchange.com/