R numéros de ligne de script à l'erreur?

Question

J'ai trouvé ce post depuis un an, et j'utilise R version 2.11.1 (2010-05-31), mais je reçois toujours des messages d'erreur sans les numéros de ligne.

Une solution?

Answer 1

Les réponses données ici sont encore valides. Renvoyer des numéros de ligne à partir d'un script n'est pas si simple, mais R peut vous donner beaucoup plus d'informations sur l'endroit où l'erreur peut être trouvée.

Vous pouvez utiliser les options d'erreur pour enregistrer les informations dans un fichier, par exemple:

options(error = quote({ 
    sink(file="error.txt"); 
    dump.frames(); 
    print(attr(last.dump,"error.message")); 
    traceback(); 
    sink(); 
    q()})) 

La fonction findLineNum() peut être utilisé si vous avez le nom du fichier disponible quelque part. Si vous avez le message d'erreur, vous pouvez faire quelque chose comme:

dump.frames() 
x <- attr(last.dump,"error.message") 
ll <- gsub("Error in (.*) : .*","\\1",x) 
lln <- findLineNum(srcfile,ll) 

Answer 2

Dans le prochain R 2,14, l'équipe de base progresse vers la mise en œuvre de cette fonction. Les fonctions des scripts chargés source(file=..., keep.file=TRUE) contiennent un attribut srcref, qui identifie la plage de caractères correspondant à la définition de la fonction dans une copie en mémoire du fichier source stocké en tant qu'objet de la classe srcfilecopy.

Ceci ne fournit pas immédiatement un débogage au niveau de la ligne, mais vous permet d'obtenir des numéros de ligne approximatifs si vous êtes prêt à vous salir les mains. Aussi, c'est un progrès.