Essayer de lire dans les tables stockées dans HDF5 stocke dans Julia comme une Dataframe

Question

J'essayais de lire dans une table stockée dans un magasin HDF5 et de le lire comme une Dataframe dans Julia. Je trouve une partie de la documentation confusion en ce qui concerne l'utilisation du paquet HDF5 dans Julia et je me demandais s'il y a quelque chose comme l'équivalent pandas géants:

table_data = pd.read_hdf('filepath', key='group') 

Mon code va comme ceci:

using HDF5 

file_input = "filepath/file.h5" 

fileop = "r" 

table_name = "group" 

h5_store = h5read(file_input, fileop) 

table_data = read(h5_store, table_name) 

close(h5_store) 

Je me demandais si ce quelque chose que je fais de manière incorrecte et apprécierait toute orientation sur ce

Answer 1

utilisation h5open au lieu de h5read pour fixer votre code:

h5_store = h5open(file_input, fileop) 

Cependant, vous pouvez utiliser h5read qui utilise par défaut l'accès en lecture seule au fichier hdf5:

using HDF5 

file_input = "filepath/file.h5" 

table_name = "table" 

table_data = h5read(file_input, table_name)