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J'essaie d'extraire des patches de nodules d'images CT en fonction des coordonnées données dans un fichier CSV. Je continue d'obtenir cette erreur msg à la ligne worldcoord: impossible de convertir la chaîne en float (CordZ). Je ne suis pas sûr de savoir comment faire cela.erreur: impossible de convertir la chaîne en float (CordZ)
Je cette jusqu'à présent:
def readCSV(filename):
def readCSV(filename): lines = []
with open(filename, 'r') as f:
csvreader = csv.reader(f)
for line in csvreader:
lines.append(line)
return lines
cands = readCSV(cand_path)
for cand in cands:
worldCoord = np.asarray([float(cand[3]),float(cand[2]),float(cand[1])])
voxelCoord = worldToVoxelCoord(worldCoord, numpyOrigin, numpySpacing)
voxelWidth = 65
patch = numpyImage[voxelCoord[0],voxelCoord[1]-voxelWidth/2:voxelCoord[1]+voxelWidth/2,voxelCoord[2]-voxelWidth/2:voxelCoord[2]+voxelWidth/2]
patch = normalizePlanes(patch)
print ('data')
print (worldCoord)
print (voxelCoord)
Pourriez-vous fournir des exemples de données que vous essayez de lire? Êtes-vous sûr que le fichier ne contient pas d'en-tête que vous avez lu comme une donnée normale au lieu de sauter? – trivelt
Salut @jboockmann, j'ai résolu cette erreur mais je reçois une nouvelle erreur sur la ligne de patch: seulement des entiers, des tranches (':'), des ellipses ('...'), numpy.newaxis ('None') et des entiers ou Les tableaux booléens sont des indices valides –
Ensuite, vous devriez ouvrir une nouvelle question et fermer celle-ci. –