Définir manuellement la couleur pour les diagrammes venn dans le package Vennerable

Question

Salut, je voudrais pouvoir attribuer manuellement les couleurs. Par exemple

library(Vennerable) 
data(StemCell) 
    w <- Venn(Sets=StemCell[1:2]) 
    plot(w, type="squares") 

produit

mais ce que je voudrais faire est de changer manaully la couleur, OCT4 = rouge, chevauchement = brun et Sox2 = vert? Est-ce possible avec le paquet actuel? ? J'ai essayé de paramétrer gpar mais ça n'a pas l'air de faire quoi que ce soit en particulier.

merci! A

Answer 1

Une partie de cela est documenté dans la vignette Vennerable (vignette ("Venn")), section 2.3 Paramètres graphiques, et la page de manuel VennThemes (? VennThemes)

La personnalisation que vous aimeriez avoir vous oblige à utiliser compute.Venn() supplémentaire à Venn(), pour calculer un diagramme approprié que vous pouvez ensuite personnaliser en utilisant VennThemes().

Le code pour votre personnalisation requis ressemble à ceci:

w <- compute.Venn(Venn(Sets=StemCell[1:2]), type = "squares") 
gp <- VennThemes(w) 
gp[["Face"]][["11"]]$fill <- "brown" 
gp[["Face"]][["01"]]$fill <- "green" 
gp[["Face"]][["10"]]$fill <- "red" 
plot(w, gp = gp) 

Vous pouvez regarder l'objet « gp », qui contient tous les paramètres de visualisation, comme remplissage du Venn qui est modifié dans le code ci-dessus, mais aussi la couleur de la ligne, du texte, etc. Amusez vous à jouer avec ça.

d'ailleurs, dans la vignette, ils font usage de paquet de réseau

library(grid) 
grid.newpage() 

pour essuyer l'ardoise. Sinon, vous complotez Venn en haut du diagramme de Venn.