R obtenir des lignes où toutes les valeurs sont NaN

Question

J'essaie d'obtenir toutes les lignes où les valeurs spécifiques (ici RATIO1 et RATIO 2) sont NaN et les garder.

envisager une trame de données comme

data.frame(ID=c(1,2,4,6,7),RATIO1=c(NaN,NaN,0.2,9.5,6), 
      RATIO2=c(NaN,NaN,0.5,NaN,6), RATIO3=c(0.3,0.2,4,NaN,5)) 

ID RATIO1 RATIO2 RATIO3 
1 1 NaN NaN 0.3 
2 2 NaN NaN 0.2 
3 4 0.2 0.5  4 
4 6 9.5 NaN NaN 
5 7  6  6  5 

Je veux que ça ressemble à ce

ID RATIO1 RATIO2 RATIO3 
1 1 NaN NaN 0.3 
2 2 NaN NaN 0.2 

je pouvais le faire en utilisant is.na() ou complete.cases() < - cela efface les lignes.

Thx

Answer 1

En supposant que vous êtes vraiment affaire avec NaN et non une valeur de caractère arbitraire, essayez quelque chose comme ceci:

dat <- data.frame(ID=c(1,2,4,6,7),RATIO1=c(NaN,NaN,0.2,9.5,6), RATIO2=c(NaN,NaN,0.5,NaN,6), RATIO3=c(0.3,0.2,4,NaN,5)) 
> dat[is.nan(dat$RATIO1) & is.nan(dat$RATIO2),] 
    ID RATIO1 RATIO2 RATIO3 
1 1 NaN NaN 0.3 
2 2 NaN NaN 0.2 

is.finite pourrait également s'avérer utile si vous faites ce genre de chose souvent.

Answer 2

est ici une possibilité, en utilisant apply() d'examiner les lignes une à la fois et déterminer si elles sont entièrement composées de NaN s:

df[apply(df[2:3], 1, function(X) all(is.nan(X))),] 
# ID RATIO1 RATIO2 RATIO3 
# 1 1 NaN NaN 0.3 
# 2 2 NaN NaN 0.2 

Answer 3

Vous pouvez utiliser ceci:

df <- data.frame(ID=c(1,2,4,6,7),RATIO1=c(NaN,NaN,0.2,9.5,6), 
        RATIO2=c(NaN,NaN,0.5,NaN,6), RATIO3=c(0.3,0.2,4,NaN,5)) 

df[is.nan(df$RATIO1) & is.nan(df$RATIO2),] 

    ID RATIO1 RATIO2 RATIO3 
1 1 NaN NaN 0.3 
2 2 NaN NaN 0.2 

Answer 4

solution améliorée basée sur ce Josh O'Briens.

df[rowSums(is.nan(as.matrix(df[2:3])))>1,] 
# 
# as.matrix because is.nan requires matrix (but is.na doesn't) 
# rowSums for speed gain 
#