mpirun conservant stdout redirigé

Je cours dans un cluster. J'ai essayé d'exécuter mon exécutable avec 4 formes différentes:mpirun conservant stdout redirigé

En série, avec
```
myexec 
```
Cela commence à donner sortie à stdout tout de suite, comme prévu.
En série, rediriger stdout et stderr, avec
```
myexec > out-err.log 2>&1 
```
Ceci commence à donner en sortie out-err.log tout de suite, comme prévu (vérifié avec cat out-err.log dans un autre terminal).
En parallèle, avec
```
mpirun -n 2 myexec 
```
Cela commence à donner sortie à stdout tout de suite, comme prévu.
En parallèle, la réorientation stdout et stderr, avec
```
mpirun -n 2 myexec > out-err.log 2>&1 
```
Cette conserve sortie jusqu'à ce travail est terminé (en raison de l'allocation d'achèvement ou de temps).

Est-il possible d'avoir stdout/stderr « rincée » lors de l'exécution dans le cas 4, donc je peux vérifier out-err.log?

2017-06-09 sancho.s

Ceci est une fonction/problème connu avec la redirection en mpi. J'ai trouvé comment résoudre ceci:

Ajouter export OMPI_MCA_opal_event_include=poll dans ~/.bashrc, ou
Ajouter opal_event_include=poll dans ~/.openmpi/mca-params.conf (le répertoire et créer/ou le fichier si elles n'existent pas).

Les sources utilisées pour obtenir des informations sont:

2017-06-09 21:50:26

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