graphe de ligne horizontale avec assambly dans R

Question

J'ai de grandes données comme le suivant mais ce juste petit échantillon.

pos <- c(1, 3, 5, 8, 10, 12) 
start <- c(1,3, 6, 7, 10, 11) 
end <- c(5, 6, 9, 9, 13, 12) 

La variable Q postive sera l'axe Y et l'axe X sera l'anthère X variable (quantitative). La longueur de la barre horizontale pour chaque valeur Pos est définie par le point de départ et de fin. Par exemple, la ligne pour 1 commencera à partir de 1 et se terminera à 3 sur l'axe des x.

Ce qui suit est un croquis approximatif de la sortie désirée.

Answer 1

Utilisation paquet ggplot2 avec geom_segment pour dessiner les lignes.

Commencez en combinant vos données dans un data.frame, étant donné que cette structure de données requises pour ggplot:

dat <- data.frame(
    pos = c(1, 3, 5, 8, 10, 12), 
    start = c(1,3, 6, 7, 10, 11), 
    end = c(5, 6, 9, 9, 13, 12) 
) 

Créer l'intrigue:

library(ggplot2) 
ggplot(dat) + 
    geom_segment(aes(x=start, y=pos, xend=end, yend=pos), color="blue", size=3) + 
    scale_y_reverse() 

Answer 2

dans la base R ..

plot(pos, type = 'n', xlim = range(c(start, end)), ylim = c(13,0)) 
grid() 
segments(start, pos, end, pos) 

Pour obtenir plus exactement comme votre silhouette ...

r <- par('usr') 
plot(pos, type = 'n', xlim = range(c(start, end)), ylim = c(13.5,0.5), xlab = '', 
    xaxt = 'n', yaxt = 'n', panel.first = rect(r[1], r[3], r[2], r[4], col = 'goldenrod')) 
# abline(h = 1:13, col = 'white') 
# abline(v = 1:13, col = 'white') 
grid(lty = 1, col = 'white') 
axis(1, 1:13, 1:13, cex.axis = 0.8) 
axis(2, 1:13, 1:13, las = 1, cex.axis = 0.8) 
segments(start, pos + 0.5, end, pos + 0.5, lwd = 2)