2017-09-08 1 views
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Ce code génère une distribution de probabilité psi_0_x_squared. Effectue ensuite une simulation de chaîne markov selon cette probabilité. Cette probabilité psi_0_x_squared est en fait la probabilité d'être à la position x pour le niveau d'énergie n = 0. Après avoir déplacé x 1000 fois selon cette probabilité, je veux générer un histogramme de la position x. (La fréquence de position)Comment puis-je modifier ce code pour afficher un histogramme avec des couleurs en fonction de la hauteur plutôt que par défaut 'cool' que j'ai choisi

''' Markov-chain Monte Carlo algorithm for a particle in a Gaussian potential, 
using the Metropolis algorithm. ''' 
import math, matplotlib.pyplot as plt, random 

def probability(x): 

    #wavefunction n=0 evaluated at position x 
    psi_0_x=math.exp(-x ** 2/2.0)/math.pi ** 0.25 

    #probability n=0 to be at position x 
    psi_0_x_squared= psi_0_x**2 

    return psi_0_x_squared 

data_x=[0] 

x = 0.0  #starts at position 0 
delta = 0.5 #stepsize 

for k in range(1000): #for this number of trials 
    x_new = x + random.uniform(-delta, delta) #I displace it a distance delta 


    if random.uniform(0.0, 1.0) < probability(x_new)/probability(x): 
     x = x_new 
    data_x.append(x) 

#histogram 
cm = plt.cm.get_cmap('cool') 
n, bins, patches= plt.hist(data_x, bins=100, normed=True, color='k') 
bin_centers = 0.5 * (bins[:-1] + bins[1:]) 
col = bin_centers - min(bin_centers) 
col /= max(col) 
for c, p in zip(col, patches): 
    plt.setp(p, 'facecolor', cm(c)) 

plt.show() 

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La variable n contient la hauteur des barreaux. Par conséquent, cela devrait faire l'affaire:

for height, p in zip(n, patches): 
    plt.setp(p, 'facecolor', cm(height)) 

comme ceci:

a = np.random.normal(size=(1000,)) 

cm = plt.cm.get_cmap('cool') 
n, bins, patches= plt.hist(a, bins=100, normed=True, color='k') 
for c, p in zip(n, patches): 
    plt.setp(p, 'facecolor', cm(c)) 

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