2010-01-10 4 views
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Quelqu'un at-il une bonne source de logiciel/tutoriel sur la simulation de génie génétique? Peut-être logiciel open source sur la simulation d'épissage/clonage de gènes?Simulation de génie génétique

Merci

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Je suppose que je peux toujours commencer à partir de http://www.amazon.com/s/ref=nb_ss?url=search-alias%3Daps&field-keywords=genetic+simulation&x=0&y=0 – portoalet

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Ce ne peut pas être exactement ce que vous êtes après, mais avez-vous regardé Spore?

Il est tout à fait possible qu'il n'existe pas de logiciel de simulation de génie génétique «sérieux». Je pense que ce serait un concept très difficile à mettre en œuvre.

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En fait, un ex-collègue À l'université Queen Elizabeth, à Londres, j'ai rédigé un simulateur de génie génétique assez complet (hachage et épissure) à l'époque du PET Commodore au début des années 1980. Je n'ai aucune idée de ce qui lui est arrivé, mais j'imagine que vous pourriez faire beaucoup mieux de nos jours. –

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Je suis corrigé, alors. Je vous remercie! –

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Excellente question! Il est clair que le génie génétique ne peut pas être simulé à un niveau analytique, c'est-à-dire. modélisation du mécanisme impliqué - parce que certains des processus, tels que le repliement des protéines, la transcription de l'ADN, etc., sont trop complexes et n'ont pas encore été modélisés. Ils travaillent encore sur une carte du génome humain, et je suis sûr qu'ils n'ont rien trouvé d'autre parce que tout ce qui est raisonnablement complexe n'est pas moins complexe (en termes de nombre de gènes) d'un humain. Par exemple, vous pouvez économiser 2% en complexité, mais alors vous avez un chimpanzé pas un humain. Cependant, il pourrait y avoir des approches possibles basées sur des méthodes empiriques - c'est-à-dire des méthodes de "meilleure estimation" ou d'expérimentation. Ainsi, vous pouvez regarder des travaux récents dans l'apprentissage automatique ou l'exploration de données pour certaines approches possibles. Il y a beaucoup de données méthodes d'extraction et d'apprentissage de la machine là-bas, allant des algorithmes génétiques, réseaux de neurones, arbres de décision, SVM, etc.

http://en.wikipedia.org/wiki/Data_mining

http://en.wikipedia.org/wiki/Machine_learning