Comment joindre plusieurs fichiers par awk

Question

Eh bien, j'ai plusieurs fichiers et j'ai du mal à les rejoindre avec awk. Voici trois exemples de fichiers:

Filea

2 2 31771 15 5327353  4.73E-04 1 1 
2 2 40642 23 27428869 -8.29E-04 1 1 
2 2 21517 7 89002990 -2.41E-04 1 1 
2 2 33787 16 44955568  2.86E-05 1 1 

FICHB

2 2 31771 15 5327353  5.07E-04 1 1 
2 2 40642 23 27428869 5.45E-04 1 1 
2 2 21517 7 89002990 1.85E-04 1 1 
2 2 33787 16 44955568 3.73E-04 1 1 

Filec

2 2 31771 15 5327353  4.28E-04 1 1 
2 2 40642 23 27428869 -7.55E-04 1 1 
2 2 21517 7 89002990 -2.01E-04 1 1 
2 2 33787 16 44955568 3.09E-05 1 1 

Chaque fichier a 8 colonnes, mais je ne pas besoin de colonnes 1, 2 , 7 et 8. Les colonnes 3, 4 et 5 sont communes à tous les fichiers, ce sont peut-être les colonnes de référence pour joi ning les fichiers, et la colonne 6 serait l'information différente de chaque fichier. En général, mon fichier final ressemblerait à ceci:

Finalfile

31771 15 5327353  4.73E-04 5.07E-04 4.28E-04 
40642 23 27428869 -8.29E-04 5.45E-04 -7.55E-04 
21517 7 89002990 -2.41E-04 1.85E-04 -2.01E-04 
33787 16 44955568 2.86E-05 3.73E-04 3.09E-05 

J'ai essayé les commandes suivantes:

awk 'NR==FNR{a[$3]=$6;next}{print $3"\t"$4"\t"$5"\t"$6"\t"a[$3]}' FileA FileB FileC > Finalfile 

Mais malheureusement, il ne fonctionne qu'avec deux fichiers, et je reçois quelque chose comme ce:

2 2 31771 15 5327353  4.73E-04 5.07E-04 
2 2 40642 23 27428869 -8.29E-04 5.45E-04 
2 2 21517 7 89002990 -2.41E-04 1.85E-04 
2 2 33787 16 44955568 2.86E-05 3.73E-04 

Quelqu'un peut-il aider? Rappelez-vous qu'il existe plusieurs fichiers (10), pas seulement trois. Merci beaucoup!

Answer 1

pour cette solution:

awk '{a[$3FS$4FS$5]=a[$3FS$4FS$5]""$6FS}END{for (i in a){print i, a[i]}}' file* 

Une version plus propre (Merci @ James-Brown):

awk '{ a[$3 OFS $4 OFS $5 FS] = a[$3 OFS $4 OFS $5 FS] (a[$3 OFS $4 OFS $5 FS] == "" ? "" : OFS) $6 } 
    END{ for (i in a){print i,a[i]} }' OFS="\t" file* 

Sortie

33787 16 44955568 2.86E-05 3.73E-04 3.09E-05 
21517 7 89002990 -2.41E-04 1.85E-04 -2.01E-04 
40642 23 27428869 -8.29E-04 5.45E-04 -7.55E-04 
31771 15 5327353  4.73E-04 5.07E-04 4.28E-04 

Answer 2

pâte + awk approche (avec "joli" sortie):

paste fileA fileB fileC | awk '{print $3,$4,$5,$6,$14,$22}' | column -tx 

La sortie:

31771 15 5327353 4.73E-04 5.07E-04 4.28E-04 
40642 23 27428869 -8.29E-04 5.45E-04 -7.55E-04 
21517 7 89002990 -2.41E-04 1.85E-04 -2.01E-04 
33787 16 44955568 2.86E-05 3.73E-04 3.09E-05