Calcul de courbe de rappel de précision par paquet PRROC dans R

Question

Ma question concerne la question this. Je suis intéressé par l'informatique Precision-Recall Curve (PRC) et la zone sous PRC. J'ai trouvé un joli paquet R PRROC pour faire les deux tâches. Selon package description (page 5) pour la fonction pr.curve, vous devez donner 2 paramètres. 1) les scores de classification des points de données appartenant à la classe positive seulement 2) les scores de classification des points de données appartenant à la classe négative seulement (Voir le manuel page 7). L'exemple fourni est:

# create artificial scores as random numbers 
x <- rnorm(1000); 
y <- rnorm(1000, -1); 
# compute PR curve 
pr <- pr.curve(x, y, curve = TRUE); 

Mon problème est que j'ai 14000 points de données en classe positif et 2560595 en classe négative datapoints et pour ces données, il est déjà 1 jour et encore je ne l'ai pas obtenu des résultats. Pour des raisons de simplicité, vous pouvez essayer une extension d'un exemple déjà donné.

# create artificial scores as random numbers 
x <- rnorm(14000); 
y <- rnorm(2560595, -1); 
# compute PR curve 
pr <- pr.curve(x, y, curve = TRUE); 

Answer 1

Vous pouvez essayer de AUPRC()PerfMeas package

Edité

Ce paquet precrec semble être mieux. Il est compatible avec ggplot2 et implémenté avec C++. Pour le résultat de l'analyse, veuillez cocher this paper