Conda - R dépendances manquantes Essentials dans le dépôt privé hors ligne

Question

Je currenty essayer d'installer le paquet essentials R pour Anaconda sur la machine Linux RedHat virtuel qui n'a pas accès à Internet (c'est pourquoi d'habitude

Conda installer c -r r-essentials

ne fonctionnera pas). Pour ce faire, j'ai téléchargé à partir de air gap le fichier repository linux-64-pkgs.tar du répertoire 2017-08/anaconda-server-sync-conda/et utilisé seulement le répertoire r (p \ pkgs \ linux-64). Puis j'ai suivi les instructions de link. Comme le répertoire contenait repodata.json et repodata.json.bz2, il n'est pas nécessaire de générer et d'indexer les fichiers en suivant this instruction. Après je cours

Conda installation r-essentials

arrive ceci:.

Fetching package metadata .... 
WARNING: The remote server could not find the noarch directory for the 
requested channel with url: file:///home/math/conda-r/repo.continuum.io/pkgs/r 

It is possible you have given conda an invalid channel. Please double-check 
your conda configuration using `conda config --show`. 

If the requested url is in fact a valid conda channel, please request that the 
channel administrator create `noarch/repodata.json` and associated 
`noarch/repodata.json.bz2` files, even if `noarch/repodata.json` is empty. 
$ mkdir noarch 
$ echo '{}' > noarch/repodata.json 
$ bzip2 -k noarch/repodata.json 
. 
Solving package specifications: 

PackageNotFoundError: Dependencies missing in current linux-64 channels: 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-base 3.2.1 -> ncurses 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-boot 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-class -> r-mass 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-cluster 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-codetools 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-foreign 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-kernsmooth 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-lattice 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-matrix 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-mgcv -> r-nlme >=3.1_64 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-nnet 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-rpart 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-spatial 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-survival 
    - r-essentials -> r-caret -> r-bradleyterry2 -> r-brglm -> r-profilemodel 
    - r-essentials -> r-caret -> r-bradleyterry2 -> r-gtools 
    - r-essentials -> r-caret -> r-bradleyterry2 -> r-lme4 >=1.0 -> r-minqa >=1.1.15 -> r-rcpp >=0.9.10 
    - r-essentials -> r-caret -> r-bradleyterry2 -> r-lme4 >=1.0 -> r-nloptr >=1.0.4 -> nlopt 
    - r-essentials -> r-caret -> r-bradleyterry2 -> r-lme4 >=1.0 -> r-rcppeigen 
    - r-essentials -> r-caret -> r-car -> r-pbkrtest >=0.3_2 
    - r-essentials -> r-caret -> r-car -> r-quantreg -> r-sparsem 
    - r-essentials -> r-caret -> r-car -> r-quantreg -> r-matrixmodels 
    - r-essentials -> r-caret -> r-foreach -> r-iterators 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-digest 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-gtable >=0.1.1 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-plyr >=1.7.1 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-proto 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-reshape2 -> r-stringr -> r-magrittr 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-reshape2 -> r-stringr -> r-stringi >=0.4.1 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-scales >=0.2.3 -> r-dichromat 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-scales >=0.2.3 -> r-labeling 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-scales >=0.2.3 -> r-munsell >=0.2 -> r-colorspace 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-scales >=0.2.3 -> r-rcolorbrewer 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-lazyeval 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-tibble -> r-assertthat 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-tibble -> r-rlang 
    - r-essentials -> r-caret -> r-modelmetrics >=1.1.0 
    - r-essentials -> r-data.table -> r-chron 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-bh >=1.58.0_1 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-dbi >=0.3 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-r6 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-bindrcpp -> r-bindr 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-bindrcpp -> r-plogr 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-glue 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-pkgconfig 
    - r-essentials -> r-glmnet 
    - r-essentials -> r-jsonlite 
    - r-essentials -> r-quantmod -> r-ttr >=0.2 -> r-xts >=0.9_3 -> r-zoo >=1.7_10 
    - r-essentials -> r-quantmod -> r-curl 
    - r-essentials -> r-randomforest 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-catools -> r-bitops 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-htmltools >=0.2.4 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-knitr >=1.6 -> r-evaluate >=0.6 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-knitr >=1.6 -> r-formatr 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-knitr >=1.6 -> r-highr 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-knitr >=1.6 -> r-markdown -> r-mime >=0.3 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-knitr >=1.6 -> r-yaml >=2.1.5 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-base64enc 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-rprojroot -> r-backports 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> pandoc >=1.15.0 
    - r-essentials -> r-shiny -> r-httpuv >=1.3.2 
    - r-essentials -> r-shiny -> r-rjsonio 
    - r-essentials -> r-shiny -> r-xtable 
    - r-essentials -> r-shiny -> r-sourcetools 
    - r-essentials -> r-tidyr 
    - r-essentials -> r-irkernel -> ipython-notebook 
    - r-essentials -> r-irkernel -> r-irdisplay -> r-repr 
    - r-essentials -> r-irkernel -> r-rzmq >=0.7.0 
    - r-essentials -> r-irkernel -> r-uuid 
    - r-essentials -> r-irkernel -> r-pbdzmq >=0.2_1 
    - r-essentials -> r-irkernel -> r-crayon -> r-memoise 
    - r-essentials -> r-rbokeh -> r-hexbin 
    - r-essentials -> r-rbokeh -> r-htmlwidgets 
    - r-essentials -> r-rbokeh -> r-maps 
    - r-essentials -> r-rbokeh -> r-gistr -> r-httr >=1.0.0 -> r-openssl >=0.8 
    - r-essentials -> r-rbokeh -> r-pryr 
    - r-essentials -> r-broom >=0.4.1 -> r-psych -> r-mnormt 
    - r-essentials -> r-forcats >=0.1.1 
    - r-essentials -> r-haven >=1.0.0 -> r-hms 
    - r-essentials -> r-haven >=1.0.0 -> r-readr >=0.1.0 
    - r-essentials -> r-lubridate >=1.6.0 
    - r-essentials -> r-modelr >=0.1.0 -> r-purrr >=0.2.2 
    - r-essentials -> r-readxl >=0.1.1 -> r-cellranger -> r-rematch 
    - r-essentials -> r-rvest >=0.3.2 -> r-selectr 
    - r-essentials -> r-rvest >=0.3.2 -> r-xml2 
    - r-essentials -> r-tidyverse >=1.0.0 

Close matches found; did you mean one of these? 

    nlopt: r-nloptr 
    pandoc: pango 

(and similarly for the other packages) 

J'ai également copié ces repodata * fichiers dans le répertoire/noarch, mais rien n'a changé sauf partie entre Fetching package metadata .... et Solving package specifications: n'est plus affiché.

Est-ce un problème de paquetage ou je fais quelque chose de mal?

Answer 1

J'ai le même problème.Mais la différence est que j'ai suivi the post et seulement téléchargé les paquets requis. Mais de façon inattendue, j'ai trouvé le paquet r-base n'a pas été téléchargé. Alors je l'ai téléchargé à nouveau. Ensuite, j'ai construit le repo conda par la commande conda index. Quand je la commande suivante:

conda install r r-essentials -c file:///opt/kevin/channel --override-channels 

Il n'a pas work.I actualiserait base de r avec le canal par défaut (il a besoin Internet) enter image description here