Est-il possible de compiler des fichiers NASA Parallel Benchmarks (NPB) sous Linux en utilisant gfortran et openmpi?

Question

Je cherche à exécuter l'analyse comparative CNLC sur mon RHEL7.3 installer mais viennent dans une question similaire à la question posée ici

Error while building NAS benchmarks

Essayer de faire la référence BT, qui est en Fortran, je reçois le erreur suivant:

cd BT; make NPROCS=16 CLASS=W SUBTYPE= VERSION= 
make[1]: Entering directory '/mnt/npb_install/NPB3.3-MPI/BT' 
make[2]: Entering directory '/mnt/npb_install/NPB3.3-MPI/sys' 
make[2]: Nothing to be done for 'all' 
make[2]: Leaving directory '/mnt/npb_install/NPB3.3-MPI/sys' 
../sys/setparams bt 16 W 
make[2]: Entering directory '/mnt/npb_install/NPB3.3-MPI/BT' 
make[3]: Entering directory '/mnt/npb_install/NPB3.3-MPI/BT' 
gfortran -O -o ../bin/bt.W.16 bt.o make_set.o initialize.o exact_solution.o exact_rhs.o set_constants.o adi.o define.o copy_faces.o rhs.o solve_subs.o x_solve.o y_solve.o z_solve.o add.o error.o verifiy.o setup_mpi.o ../common/print_results.o ../common/timers.o btio.o -L/usr/lib/openmpi-x84_64/ -lmpi 
/bin/ld: cannot find -lmpi 
collect2: error: ld returned 1 exit status 
make[3]: *** [bt-bt] Error 1 
make[3]: Leaving direc....... 

Cependant, je ne suis pas utilise Intel MPI mais OpenMPI, bien que je ne comprends pleinement l'implication de cela.

Mon fichier make.def a les paramètres liés mpi suivants

#------------------------------------- 
# This is the fortran compiler usedd for MPI programs 
#----------------------------------------- 
MPIF77 = gfortran 
# This links MPI fortran programs; usually the same as ${MPIF77} 
FLINK = ${MPIF77} 

#------------------------------------------ 
# These macros are passed to the linker to help link with MPI correctly 
#------------------------------------------- 
FMPI_LIB = -L/usr/lib/openmpi/lib/ -lmpi 

#----------------------------------------- 
# These macros are passed to the compiler to help find 'mpif.h' 
#------------------------------------------ 
FMPI_INC = -I/usr/include/openmpi-x86_64/ 

similaires à ceux affichés dans la question ci-dessus.

De l'erreur, je suppose que les paramètres d'entrée -lmpi est pas un paramètre d'entrée valable pour gfortran lors de la compilation, mais l'enlever conduit à un écran plein de références non définies comme:

file.f:(.text+0x123): undefined reference to 'mpi_whatever_' 

Est-il possible de compiler NPB avec gfortran? Ou est-ce que je fais clairement quelque chose de mal ici? J'ai vu qu'utiliser ifort est une autre option, mais je pensais poser la question avant d'aller vers cette solution possible

Answer 1

Après avoir piraté, j'ai résolu le problème avec les correctifs suivants, je ne sais pas ce qu'il a fait.

OpenMPI peut-être pas été installé correctement (n'a pas pu appeler mpicc ou d'autres wrappers/comps), pour le fixer, je courais les commandes suivantes

module avail 
#displayed the openmpi-x86_64 module 
module add open-x86_64 
which mpirun 
#displayed location of mpirun 

Le correctif plus probable est en train de changer simplement gfortran en le fichier make.def à mpif77