Comment visualiser la matrice de distance produite par Vegdist dans Vegan?

Question

Avec le package R Vegan une matrice de distance peut être produite avec le funciton de vegdist:

distance.matrix <- vegdist(my.data) 

Je voudrais réellement montrer la matrice de distance dans une présentation pour expliquer ce que l'intrigue SNDM de celui-ci est basé sur. Comment puis-je faire ceci? 'Distance.matrix' est 'Classe' dist 'atomique ...'

' Je veux juste le voir dans un tableau montrant à quel point chaque site est éloigné l'un de l'autre?

Answer 1

Vous voulez voir la matrice de distance? Qu'en est-il de taper son nom?

distance.matrix 
as.matrix(distance.matrix) # in full symmetric form 

Ou si vous voulez le voir graphique, essayez

heatmap(as.matrix(distance.matrix)) 

Plusieurs paquets ont probablement des outils fantaisistes.