Conserver zéro valeur dans heatmap2 comme aucune valeur

Question

J'utilise gplots et Rcolorbrewer pour faire un heatmap en utilisant la fonction heatmap2().
Mes données ont des zéros indiquant qu'aucune donnée n'est enregistrée dans ces échantillons. Pour créer la carte thermique, je veux que ces zéros soient colorés en blanc et le reste en haut dans une légende en trois couleurs.

Voici le code à ce jour:

my_palette <- colorRampPalette(c("blue", "green", "red"))(n = 299) 
col_breaks = c(seq(0.001,0.2,length=100), seq(0.3,0.4,length=100), seq(0.5,0.6,length=100)) 

library(gplots) 
heatmap.2(deco.hmBB, main = "BCC at day 0 and day 10", margins = c(6,9), trace = "none", 
density.info = "none", dendrogram = "none", col = my_palette, breaks = col_breaks, 
Colv = "NA") 

Answer 1

Comme commenté, remplacer les zéros Nas comme ceci:

deco.hmBB[deco.hmBB == 0] <- NA 

réexécutez Maintenant, le heatmap, ajoutant na.color.

heatmap.2(deco.hmBB, main = "BCC at day 0 and day 10", margins = c(6,9), 
trace = "none", density.info = "none", dendrogram = "none", 
col = my_palette, breaks = col_breaks, Colv = "NA", na.color = "White")