.Renviron fichier introuvable dans le lot

J'ai un fichier ".Renviron" mais R ne semble pas le trouver si je cours un fichier R en mode batch. Si j'inclus.Renviron fichier introuvable dans le lot

source(paste0(Sys.getenv("HOME"),"\\.Renviron"),echo=TRUE)

la sortie des rapports correctement

R_LIBS = "D:\\R\\library"

Mais ne se trouvent pas les paquets dans ce répertoire. J'ai essayé R CMD BATCH et Rterm.exd <source>sortie2>&1, la bibliothèque de paquets est introuvable à l'aide de l'une ou l'autre méthode. Est-ce que quelqu'un sait ce que je fais mal? J'utilise R 3.3.2 sous Windows 7.

Source

2016-11-07 ckx

Sortie '.libPath()' lors de l'exécution dans Batch. Qu'est ce que tu obtiens? – csgillespie

J'ai un problème très similaire. Si je lance R à partir de l'invite de commande, R ne charge que .Renviron s'il se trouve dans le répertoire à partir duquel je lance R. Ma compréhension est que R devrait chercher .Renviron dans le répertoire personnel de l'utilisateur, mais cela ne fonctionne pas . – billelev

Ce qui est vraiment étrange, c'est qu'un fichier .Rprofile dans mon répertoire personnel est trouvé. Pour contourner le problème, j'ai créé un fichier de commandes Windows qui définit R_LIBS: 'D: \ R \ R-3.3.2 \ bin \ x64 \ Rterm.exe --no-restore --no-save --file ="% ~ 1.R ">"% ~ 1.out "2> & 1 R_LIBS = D:/R/bibliothèque'. Kludgey mais ça marche. – ckx

J'ai résolu un problème similaire dans R 3.2.0 par creating a user environment variable R_ENVIRON_USER qui pointait vers mon fichier .Renviron. RSTudio, semble-t-il, charge .Renviron à partir de% userprofile%/Documents mais la ligne de commande R par défaut à seulement% userprofile%. La création d'une variable d'environnement système rend le comportement cohérent pour RStudio et la ligne de commande. Pour plus d'informations, voir this webpage pour plus d'informations.

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2016-11-08 17:31:29 billelev

Merci pour la suggestion mais je n'ai pas les droits d'administrateur. J'ai essayé de définir une variable d'environnement dans un fichier de commandes Windows mais cela n'a pas été reconnu. – ckx

.Renviron fichier introuvable dans le lot

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