Qsub conduit au script ne fonctionne pas: "Command not found"

Question

Je cours un script "example.sh" qui accepte 5 arguments de ligne de commande.

Cela fonctionne très bien:

./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5 

et retourne un fichier result1.txt

Maintenant, lorsque je tente de l'exécuter sur le cluster de SGE (avec ou sans "./"):

qsub ./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5 

Ceci n'entraîne aucune sortie.

Dans le fichier example.sh.eXXXXXXX, je reçois:

arg1=1: Command not found. 
arg2=2: Command not found. 
... 
and so on. 

Je ne sais pas pourquoi il ne fonctionne pas avec la commande qsub. J'ai également inséré un

#!/usr/bin/env bash 

en haut de mon script. J'ai peaufiné des trucs pendant un moment, essayant différentes choses que j'ai trouvées sur stackoverflow et sur le web, mais pas de succès jusqu'ici (j'ai essayé les drapeaux -S et -F). Toutes les suggestions sont appréciées pour me diriger dans la bonne direction.

Answer 1

qsub n'acceptera pas les arguments de script shell comme ça, mais l'un de ces travailleront:

1) Mettre ./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5 dans un autre script, par exemple command.sh, puis exécutez qsub command.sh.

2) Pipe votre commande complète dans qsub comme entrée standard, par exemple: echo ./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5 | qsub.