J'ai une erreur lors de l'importation de modules utilisant PyCharm qui ne se produit pas lors de l'utilisation de Jupyter Notebook

Question

Pour un projet, j'ai besoin d'importer un fichier DICOM à partir d'une source de données variable. Je travaille sur le projet dans PyCharm car je finirai par itérer sur le code et le produit final sera un programme. L'erreur que je reçois est la suivante:

---

2017-10-10 08: 58: 16,307 Python [1010: 26876] - [NSApplication _setup:]: sélecteur non reconnu envoyé à l'instance 0x105154320

2017- 10-10 08: 58: 16.311 Python [1010: 26876] *** App terminaison due à l'exception non interceptée 'NSInvalidArgumentException', raison: '- [NSupplication _setup:]: sélecteur non reconnu envoyé à l'instance 0x105154320'

** * Pile d'appel du premier lancer:

(

0 CoreFoundation      0x00007fff9e92757b __exceptionPreprocess + 171 
1 libobjc.A.dylib      0x00007fffb3b801da objc_exception_throw + 48 
2 CoreFoundation      0x00007fff9e9a7f14 -[NSObject(NSObject) doesNotRecognizeSelector:] + 132 
3 CoreFoundation      0x00007fff9e89ac93 ___forwarding___ + 1059 
4 CoreFoundation      0x00007fff9e89a7e8 _CF_forwarding_prep_0 + 120 
5 Tk         0x000000010438cc02 TkpInit + 471 
6 Tk         0x00000001043082a9 Tk_Init + 1794 
7 _tkinter.cpython-36m-darwin.so  0x00000001041e0dfd Tcl_AppInit + 77 
8 _tkinter.cpython-36m-darwin.so  0x00000001041de849 _tkinter_create + 889 
9 Python        0x000000010006a7b8 _PyCFunction_FastCallDict + 552 
10 Python        0x00000001000f4164 call_function + 612 
11 Python        0x00000001000f5b74 _PyEval_EvalFrameDefault + 5604 
12 Python        0x00000001000f3500 _PyEval_EvalCodeWithName + 2720 
13 Python        0x00000001000f43c7 _PyFunction_FastCallDict + 439 
14 Python        0x000000010000ea54 _PyObject_FastCallDict + 356 
15 Python        0x000000010000f120 _PyObject_Call_Prepend + 208 
16 Python        0x000000010000e443 PyObject_Call + 99 
17 Python        0x0000000100089af1 slot_tp_init + 81 
18 Python        0x00000001000802b4 type_call + 212 
19 Python        0x000000010000e9a4 _PyObject_FastCallDict + 180 
20 Python        0x00000001000f3fa5 call_function + 165 
21 Python        0x00000001000f5b74 _PyEval_EvalFrameDefault + 5604 
22 Python        0x00000001000f3eae fast_function + 606 
23 Python        0x00000001000f414b call_function + 587 
24 Python        0x00000001000f5b74 _PyEval_EvalFrameDefault + 5604 
25 Python        0x00000001000f3500 _PyEval_EvalCodeWithName + 2720 
26 Python        0x00000001000f3d2b fast_function + 219 
27 Python        0x00000001000f414b call_function + 587 
28 Python        0x00000001000f5b74 _PyEval_EvalFrameDefault + 5604 
29 Python        0x00000001000f3500 _PyEval_EvalCodeWithName + 2720 
30 Python        0x00000001000f43c7 _PyFunction_FastCallDict + 439 
31 Python        0x000000010000ea54 _PyObject_FastCallDict + 356 
32 Python        0x000000010000f120 _PyObject_Call_Prepend + 208 
33 Python        0x000000010000e443 PyObject_Call + 99 
34 Python        0x0000000100089af1 slot_tp_init + 81 
35 Python        0x00000001000802b4 type_call + 212 
36 Python        0x000000010000e9a4 _PyObject_FastCallDict + 180 
37 Python        0x00000001000f3fa5 call_function + 165 
38 Python        0x00000001000f5b74 _PyEval_EvalFrameDefault + 5604 
39 Python        0x00000001000f3500 _PyEval_EvalCodeWithName + 2720 
40 Python        0x00000001000f3d2b fast_function + 219 
41 Python        0x00000001000f414b call_function + 587 
42 Python        0x00000001000f5b74 _PyEval_EvalFrameDefault + 5604 
43 Python        0x00000001000f3500 _PyEval_EvalCodeWithName + 2720 
44 Python        0x00000001000f3d2b fast_function + 219 
45 Python        0x00000001000f414b call_function + 587 
46 Python        0x00000001000f5b74 _PyEval_EvalFrameDefault + 5604 
47 Python        0x00000001000f3500 _PyEval_EvalCodeWithName + 2720 
48 Python        0x00000001000f36a4 PyEval_EvalCode + 100 
49 Python        0x000000010013000e PyRun_FileExFlags + 206 
50 Python        0x00000001001302af PyRun_SimpleFileExFlags + 447 
51 Python        0x0000000100149b3a Py_Main + 3914 
52 Python        0x0000000100000dfe Python + 3582 
53 Python        0x0000000100000c34 Python + 3124 
54 ???         0x0000000000000002 0x0 + 2 

) libC++ abi.dylib: mettre fin à l'exception de uncaught de type NSException

processus terminé avec le code de sortie 134 (interrompu par le signal 6: SIGABRT)

---

Le code qui me donne l'erreur est la suivante:

import pydicom 
from tkinter import filedialog 
from matplotlib import pylab 

"""Get fileName""" 
#from tkinter import filedialog 
filename = filedialog.askopenfilename() 

"""Import DICOM File""" 
#import pydicom 
df = pydicom.read_file(filename) 
dim = df.pixel_array 

"""Show DICOM Image""" 
#from matplotlib import pylab 
pylab.imshow(dim, cmap="gray") 
pylab.show() 

---

Ce code exact ne produit pas la même erreur lorsqu'il est exécuté en tant que fichier bloc-notes jupyter ou lorsque les importations sont positionnées sur les lignes commentées.

Je ne sais pas pourquoi cela est et j'espère que vous savez pourquoi je reçois cette erreur. Je voudrais avoir les importations du module au sommet du script, parce que, bien, la propreté et d'autres choses.

Merci d'avance!

Answer 1

Je pense que c'est un problème avec le backend matplotlib TkAgg. Essayez ce qui suit pour la bibliothèque matplotlib

import matplotlib 
matplotlib.use("TkAgg") 
from matplotlib import pyplot as plt