utilisant envfit avec des vecteurs de différentes grandeurs dans R

Question

Lors de l'utilisation d'envfit dans le paquet végétalien, l'importance de chaque paramètre est-elle importante?

J'ai deux dataframes:

bwsp: abondances invertébrées

bwenv: cinq paramètres environnementaux (distance, la profondeur, le débit, la chlorophylle, phaeophytine)

Trois de mes paramètres ont des grandeurs similaires, et les deux autres sont 2-3 ordres de grandeur plus petits. Les plus petits paramètres n'apparaissent pas sur le tracé MDS.

m <- metaMDS(bwsp) 
ef <- envfit(m, bwenv, perm = 1000, na.rm = TRUE) 
ef 
plot(m) 
plot(ef, add = T, p. = 0.05) 

Answer 1

envfit est basée sur la corrélation et l'ampleur d'origine n'a aucune influence sur ses résultats. Cependant, vous avez spécifié P - limite de valeur p. = 0.05 dans votre graphique, ce qui peut avoir entraîné la perte de certaines variables.

Ceci est une estimation, car vous ne fournissez pas d'exemple reproductible.