Existe-t-il des outils open source disponibles pour la détection de séquences chimériques?

Question

Existe-t-il des outils pour détecter et supprimer des séquences chimériques des séquences 16S, WGS, WTS autres que USearch. L'alternative devrait être open source afin qu'elle puisse être utilisée à des fins commerciales.

Answer 1

Il y a http://qiime.org/tutorials/chimera_checking.html Si j'ai bien compris votre question, cela suffirait.

Answer 2

VSEARCH est une autre réponse open source à USEARCH.