Erreur: Impossible de trouver la fonction « ImportMethodFrom »

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J'ai essayé d'exécuter le code dans le chapitre 7 L'exploration de données R apprentissage avec étude de cas livre, mais je suis une erreur dans la ligne suivante:Erreur: Impossible de trouver la fonction « ImportMethodFrom »

rankWorkflows(svm, maxs = TRUE)

L'erreur était:

Error in as.character.default(X[[i]], ...) : no method for coercing this S4 class to a vector

Je recherche Internet et a trouvé la solution suivante:

importMethodsFrom(GenomicRanges, as.data.frame)

et encore à nouveau Je suis une nouvelle erreur:

Error: could not find function "importMethodFrom"

je cherchais beaucoup, mais je n'ai rien :(

Source

2017-07-04 Bastian Gata

vous manque probablement la bibliothèque où 'importMethodFrom' se trouve – Bea

ouais je sais mais je ne connais pas le nom de la bibliothèque, je ne pourrais pas le trouver –

Est-ce que' importMethodsFrom' n'est pas utilisé dans les fichiers 'NAMESPACE'? Essayez de charger toute la bibliothèque 'GenomicRanges' en utilisant' library (GenomicRanges) ' –

Vous pouvez essayer d'utiliser library(sos) pour trouver les paquets où votre fonction.

library(sos) 
findFn("replaceherewithyourfunction")

Source

2017-07-04 12:11:03 Bea

J'ai reçu ce message: le téléchargement du paquet 'sos' a échoué –

Avez-vous un message d'erreur d'accompagnement? – Bea

juste cette erreur –

Sur la base de la réponse de @Bea, il ne semble pas être un importMethodsFrom partout dans R. Ma conjecture est que vous avez trouvé l'appel dans un fichier NAMESPACE. Ces fichiers ont une syntaxe différente de celle des scripts R normaux.

Si vous voulez charger une fonction spécifique d'un paquet R (plutôt que toutes les fonctions d'un paquet), vous pouvez utiliser libraryname::functionname instad de functionname dans votre code. Dans votre cas, remplacez as.data.frame avec GenomicRanges::as.data.frame

Si cela ne fonctionne pas (par exemple parce que vous n'avez pas as.data.frame nulle part dans votre code), vous pouvez également charger toute la bibliothèque GenomicRanges avec library(GenomicRanges)

Source

2017-07-04 12:16:19

J'ai trouvé ce message: standardGeneric pour "as.data.frame" défini à partir du paquet "BiocGenerics" fonction (x, row.names = NULL, facultatif = FALSE, ...) standardGeneric ("as .data.frame ") Des méthodes peuvent être définies pour les arguments: x Utilisez showMethods (" as.data.frame ") pour les options actuellement disponibles. –

Avez-vous essayé de charger la bibliothèque avec 'library (GenomicRanges)' avant d'appeler 'rankWorkflows'? –

J'ai essayé mais ça n'a pas marché –

Erreur: Impossible de trouver la fonction « ImportMethodFrom »

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