matrices creuses avec GSL - erreur de compilation

Question

Je suis en train de tester la bibliothèque scientifique GNU (GSL) et je veux en créer une matrice clairsemée. Ceci est mon code qui provient directement de https://www.gnu.org/software/gsl/manual/html_node/Sparse-Matrix-Examples.html:

#include <stdio.h> 
#include <stdlib.h> 

#include <gsl/gsl_spmatrix.h> 

int 
main() 
{ 
    gsl_spmatrix *A = gsl_spmatrix_alloc(5, 4); /* triplet format */ 
    gsl_spmatrix *C; 
    size_t i, j; 

    /* build the sparse matrix */ 
    gsl_spmatrix_set(A, 0, 2, 3.1); 
    gsl_spmatrix_set(A, 0, 3, 4.6); 
    gsl_spmatrix_set(A, 1, 0, 1.0); 
    gsl_spmatrix_set(A, 1, 2, 7.2); 
    gsl_spmatrix_set(A, 3, 0, 2.1); 
    gsl_spmatrix_set(A, 3, 1, 2.9); 
    gsl_spmatrix_set(A, 3, 3, 8.5); 
    gsl_spmatrix_set(A, 4, 0, 4.1); 

    printf("printing all matrix elements:\n"); 
    for (i = 0; i < 5; ++i) 
     for (j = 0; j < 4; ++j) 
      printf("A(%zu,%zu) = %g\n", i, j, 
      gsl_spmatrix_get(A, i, j)); 

    /* print out elements in triplet format */ 
    printf("matrix in triplet format (i,j,Aij):\n"); 
    for (i = 0; i < A->nz; ++i) 
     printf("(%zu, %zu, %.1f)\n", A->i[i], A->p[i], A->data[i]); 

    /* convert to compressed column format */ 
    C = gsl_spmatrix_compcol(A); 

    printf("matrix in compressed column format:\n"); 
    printf("i = [ "); 
    for (i = 0; i < C->nz; ++i) 
     printf("%zu, ", C->i[i]); 
    printf("]\n"); 

    printf("p = [ "); 
    for (i = 0; i < C->size2 + 1; ++i) 
     printf("%zu, ", C->p[i]); 
    printf("]\n"); 

    printf("d = [ "); 
    for (i = 0; i < C->nz; ++i) 
     printf("%g, ", C->data[i]); 
    printf("]\n"); 

    gsl_spmatrix_free(A); 
    gsl_spmatrix_free(C); 

    return 0; 
} 

Je compilé ce code en utilisant la commande suivante:

gcc test1.c -o test -lgsl -lgslcblas -lm 

Le résultat était:

/tmp/ccyBfp0p.o: In function `main': 
test1.c:(.text+0x13): undefined reference to `gsl_spmatrix_alloc' 
test1.c:(.text+0x40): undefined reference to `gsl_spmatrix_set' 
test1.c:(.text+0x69): undefined reference to `gsl_spmatrix_set' 
test1.c:(.text+0x87): undefined reference to `gsl_spmatrix_set' 
test1.c:(.text+0xb0): undefined reference to `gsl_spmatrix_set' 
test1.c:(.text+0xd9): undefined reference to `gsl_spmatrix_set' 
/tmp/ccyBfp0p.o:test1.c:(.text+0x102): more undefined references to `gsl_spmatrix_set' follow 
/tmp/ccyBfp0p.o: In function `main': 
test1.c:(.text+0x189): undefined reference to `gsl_spmatrix_get' 
test1.c:(.text+0x25d): undefined reference to `gsl_spmatrix_compcol' 
test1.c:(.text+0x39b): undefined reference to `gsl_spmatrix_free' 
test1.c:(.text+0x3a7): undefined reference to `gsl_spmatrix_free' 
collect2: error: ld returned 1 exit status 

J'essayé d'utiliser la code suivant à compiler:

gcc -I/usr/local/include/gsl -L/usr/local/lib -o test test1.c -lgsl -lgslcblas -lm 

Cette compilé le code sans erreur mais quand j'ai essayé de l'exécuter l'erreur suivante:

./test: error while loading shared libraries: libgsl.so.19: cannot open shared object file: No such file or directory 

Mais quand je fais:

ls /usr/local/lib 

je peux voir le résultat:

libemon.a  libgslcblas.so  libgsl.so   python2.7 
libgsl.a  libgslcblas.so.0  libgsl.so.19  python3.4 
libgslcblas.a libgslcblas.so.0.0.0 libgsl.so.19.1.0 site_ruby 
libgslcblas.la libgsl.la    pkgconfig 

Je pense avoir un problème avec mon installation GSL. Mais le problème est, tous les autres calculs fonctionnent bien! Seule la matrice clairsemée me donne ce problème.

Answer 1

Est-ce que la mise à jour $LD_LIBRARY_PATH comme suit fixe le error while loading shared libraries?

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH