Modifier l'axe avec R dans "survminer" pour ggforest (parcelle forestière)

Question

Lorsque j'essaie de changer l'axe d'un graphe de forêt que j'ai généré en utilisant ggforest (à partir du paquet survminer), le tracé change complètement.

Par exemple:

#Example data set 
mydata <- data.frame(A = c(8, 6, 42, 97, 55, 1, 5, 7, 55, 4), 
        B = c(93, 9, 65, 2, 51, 89, 1, 1, 5, 62), 
        C = c(68.41, 68.86, 47.26, 31.06, 42.97, 69.16, 47.39, 56.57, 19.63, 45.58), 
        D = c(0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0), 
        time = c(1.6, 34.6, 1.5, 35.8, 7.7, 38.6, 40.2, 4.7, 37.6, 8.6), 
        event= c(1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1)) 


OS <- mydata$time 
Event<-mydata$event 
A<-mydata$A 
B<-mydata$B 
C<-mydata$C 
D<-mydata$D 


# load packages 
library("survival") 
library("survminer") 

# dependent and independent variables 
y <- Surv(OS, Event) 
x <- cbind(A, B, C, D) 

#cox regression 
cox<-coxph(y~x, data=mydata, method= "breslow") 
summary(cox) 


#Forest PLot using surv miner 

ggforest(cox, alpha = 0.05, plot.title = "Forest plot for Cox proportional hazard model") 

Which produces this plot

Et si je tente de changer l'axe, comme si ..

ggforest(cox, alpha = 0.05, plot.title = "Forest plot for Cox proportional hazard model", xlim=c(-10,10000)) 

..it looks like this Est-ce que quelqu'un sait une solution à cela?

Answer 1

Voici une solution basée sur coord_flip avec l'option ylim:

ggforest(cox, alpha = 0.05, plot.title = "Forest plot for Cox proportional hazard model") + 
    coord_flip(ylim=c(10^(-4),10^6))