ne peut pas installer rdkit dans ubuntu 11.10

Question

J'ai passé de nombreuses heures à essayer de construire RDKit sur ubuntu 11.10 pour Python 2.7 (+ rdkit_201106 dfsg.orig.tar.gz) en utilisant une version pré-compilée de boost 1,49. Et je manque lamentablement.

L'erreur récurrente est dans l'interface graphique CMake:

CMake Error at CMakeLists.txt:11 (install): 

    install FILES given no DESTINATION! 



    CMake Error at CMakeLists.txt:14 (add_pytest): 


    Unknown CMake command "add_pytest". 

Toute aide s'il vous plaît?

résolu le problème précédent, mais maintenant je cette erreur lorsque python en cours d'exécution, même si j'ai installé rdkit suivant la procédure d'installation:

from rdkit import Chem 
Traceback (most recent call last): 
    File "<stdin>", line 1, in <module> 
ImportError: No module named rdkit 

Answer 1

assurez-vous que les variables d'environnement définies: (vous pourriez avoir besoin de fixer les chemins avec ce que vous avez): en utilisant bash sur mac:

export RDBASE=/usr/local/share/RDKit 
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/usr/local/lib/python2.7/site-packages 

vous pouvez ajouter ces lignes à un script bash pour automatiser le processus.

Answer 2

Pour Ubuntu 12.04.2 LTS La définition de cette variable d'environnement fonctionne pour moi

export RDBASE=/usr/share/RDKit 
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/usr/lib/pymodules/python2.7