J'ai essayé de fusionner différents fichiers de délimitation d'onglet en un seul fichier à l'aide de la commande R suivante.Suppression d'une colonne supplémentaire dans le fichier de délimitation d'onglet
Si vous observez, je sauve même le fichier en utilisant la commande write.table. Maintenant, j'ai besoin de lire les mêmes fichiers pour une analyse plus approfondie. Le plus gros problème auquel je suis confronté est qu'il existe une colonne supplémentaire sans aucun nom de colonne créé automatiquement. Si vous constatez qu'une colonne (couleur rouge) est créée automatiquement lorsque j'utilise la fonction write.table. Je veux me débarrasser de cette colonne car elle gêne tous les autres calculs.
combine=function(file) {
split_list <- unlist(strsplit(file,split=","))
setwd("D:/combine")
dataset <- do.call("cbind",lapply(split_list,FUN=function(files) { read.table(files,header=TRUE, sep="\t") }))
names(dataset)[1]=paste("Probe_ID")
drop=c("ProbeID")
dataset=dataset[,!(names(dataset)%in%drop)]
dataset$X=NULL
write.table(dataset,file="D:/output/illumina.txt",sep="\t",col.names=NA)
return ("illumina.txt")
}
merci beaucoup James – Dinesh
Pas de problème. Ne pas oublier d'accepter la réponse si elle résout le problème;) – James
James.if vous observez les noms de ma colonne, vous trouverez le "X" est ajouté à array_name (ie.X448 ...). Je ne sais pas comment pour se débarrasser de cela parce que ce n'est pas la partie du nom du tableau .. toute aide :-) – Dinesh