Le niveau de niveau de réseau échoue seulement sous RApache

Question

Je travaille sur une application web PHP qui appelle R à travers curl et RApache. La plupart des choses fonctionnent bien. Mais un complot réseau jette cette erreur:

RApache Warning/Error!!!Error in uy + c(-1, 1) : non-numeric argument to binary operator

J'ai essayé sauver les structures de données qui alimentent l'intrigue et de faire la parcelle dans mon R local, mais l'intrigue fonctionne très bien. Donc, je ne peux pas reproduire l'erreur.

Ce sont les bibliothèques chargées lorsque le script est exécuté dans Rapache:

library(Brew) 
library(Cairo) 
library(rjson) 
library(DBI) 
library(RMySQL) 
library(reshape) 
library(plyr) 
library('RColorBrewer') 
library(ggplot2) 
library(lattice) 
library(latticeExtra) 
library(hexbin) 

Voici un peu du script:

colgrad.pal<-colorRampPalette(brewer.pal(11,'Spectral'), interpolate='spline') 

//problem plot 
dists.med.lplot<-levelplot(value~starttime+groupname|dists, data=MDist.median, 
    col.regions=rev(colgrad.pal(200)),colorkey=list(col=rev(colgrad.pal(200))), 
    xlab='Time(s)',ylab='Treatment', 
    main='Level Plot of Median Distance', 
    layout=c(1,3)) 

Et voici un lien vers un fichier de données. Je l'ai lu dans comme ceci: // lien apparaît peu fiable, donc retirée

données ressemble à ceci:

'data.frame': 2880 obs. of 6 variables: 
$ groupname: Factor w/ 8 levels "rowA","rowB",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
$ fCycle : Factor w/ 6 levels "Cycle 1","Cycle 2",..: 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 ... 
$ fPhase : Factor w/ 2 levels "Dark","Light": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
$ starttime: int 0 60 120 180 240 300 360 420 480 540 ... 
$ dists : Factor w/ 3 levels "inadist","lardist",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
$ value : num 47.5 64 78.3 39.2 53.7 ... 

Toutes les idées sur ce que le problème est ou comment mieux résoudre ce?

version ETA/info plate-forme

 [platform] => sparc-sun-solaris2.10 
     [arch] => sparc 
     [os] => solaris2.10 
     [system] => sparc, solaris2.10 
     [status] => 
     [major] => 2 
     [minor] => 10.1 
     [year] => 2009 
     [month] => 12 
     [day] => 14 
     [svn rev] => 50720 
     [language] => R 
     [version.string] => R version 2.10.1 (2009-12-14) 

Answer 1

L'erreur odeurs d'un problème avec vos données. Je les opérations suivantes:

• avant l'appel réel à plot() et al, sauvegarder toutes vos données (pertinentes) via save(x, y, z, ..., file="/tmp/dbg.RData")
• puis charger toutes les données pertinentes à partir du fichier enregistré dans une R « normale » session et inspecter et comparer
• cela devrait vous permettre de repérer un problème de données que vous pourriez alors contourner avec plus de vérifications de sécurité, etc. pour empêcher votre code de tomber.