L'installation de R openair échoue après la mise à niveau vers MRAN 3.4.1

Question

J'ai utilisé le paquet openair sur mon mac avec Rstudio et MRAN v 3.4 pendant un certain temps sans problème. J'ai récemment mis à jour MRA v 3.4.1 et je reçois maintenant les messages suivants, qui finissent par se terminer par une erreur. Suggestions sur comment réparer apprécié.

> install_github('davidcarslaw/openair') 
Downloading GitHub repo davidcarslaw/openair@master 
from URL https://api.github.com/repos/davidcarslaw/openair/zipball/master 
Installing openair 
'/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore --quiet CMD INSTALL \ 
    '/private/var/folders/bv/881_rsvd2kv83c13yywwc_xh0000gn/T/Rtmpz6778s/devtoolscf5234a1e7d/davidcarslaw-openair-b782399' \ 
    --library='/Users/gcn/Library/R/3.4/library' --install-tests 

* installing *source* package ‘openair’ ... 
** libs 
clang-omp++ -fopenmp -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I"/Users/gcn/Library/R/3.4/library/Rcpp/include" -DU_STATIC_IMPLEMENTATION -Wall -mtune=core2 -g -O2 -I/opt/X11/include -fPIC -g -O3 -Wall -pedantic -mtune=native -std=c++11 -c cluster.cpp -o cluster.o 
clang-omp -fopenmp -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I"/Users/gcn/Library/R/3.4/library/Rcpp/include" -DU_STATIC_IMPLEMENTATION -Wall -mtune=core2 -g -O2 -I/opt/X11/include -fPIC -g -O3 -Wall -pedantic -mtune=native -std=gnu99 -c init.c -o init.o 
init.c:26:2: warning: no newline at end of file [-Wnewline-eof] 
} 
^ 
1 warning generated. 
clang-omp++ -fopenmp -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I"/Users/gcn/Library/R/3.4/library/Rcpp/include" -DU_STATIC_IMPLEMENTATION -Wall -mtune=core2 -g -O2 -I/opt/X11/include -fPIC -g -O3 -Wall -pedantic -mtune=native -std=c++11 -c rolling.cpp -o rolling.o 
clang-omp++ -fopenmp -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress -L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/clang4/lib -o openair.so cluster.o init.o rolling.o -framework Accelerate -L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin15/6.1.0 -L/usr/local/gfortran/lib -lgfortran -lquadmath -lm -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation 
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin15/6.1.0' 
installing to /Users/gcn/Library/R/3.4/library/openair/libs 
** R 
** data 
*** moving datasets to lazyload DB 
** inst 
** byte-compile and prepare package for lazy loading 
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 
    unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4.1-MRO/Resources/library/Matrix/libs/Matrix.so': 
    dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4.1-MRO/Resources/library/Matrix/libs/Matrix.so, 6): Library not loaded: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib/libRlapack.dylib 
    Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4.1-MRO/Resources/library/Matrix/libs/Matrix.so 
    Reason: image not found 
ERROR: lazy loading failed for package ‘openair’ 
* removing ‘/Users/gcn/Library/R/3.4/library/openair’ 
Installation failed: Command failed (1) 

Answer 1

Ce problème a disparu après avoir désinstallé toutes les versions R et installé la version 3.4.2 MRAN quand il est sorti. Selon le support du logiciel MRAN "Vous avez raison, c'est un bug dans MRO 3.4.1 Parce que MRO utilise les bibliothèques Accelerate pour les opérations BLAS et LAPACK, il ne crée pas les libRblas et libRlapack dylibs, les paquets binaires qui utilisent ces bibliothèques sont actuellement incompatible avec MRO, mais le type de paquetage par défaut a été mis dans MRO 3.4.1 à "macbinary-el-capitan" .Cela a été changé dans le prochain MRO 3.4.2 à la "source" originale. "