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IllegalStateException lors de la migration de bases de données de SonarQube 5.3 à 5.6.2 (et 5.5)

2016-09-25 2 views
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Lors de la tentative de mise à niveau des bases de données de SonarQube 5.3 vers SonarQube 5.6.2, j'obtiens une "java.lang.IllegalStateException" avec le message "Impossible de décompresser et désérialiser les données source "(provoqué à l'origine par com.google.protobuf.InvalidProtocolBufferException: le flux est corrompu). J'ai essayé ceci avec plusieurs bases de données différentes (nous avons quelque chose comme 40 équipes utilisant SonarQube 5.3 et voulant mettre à niveau) et avec les deux 5.5 (au cas où un plus petit pas aurait fonctionné) et 5.6.2. J'ai la même erreur.IllegalStateException lors de la migration de bases de données de SonarQube 5.3 à 5.6.2 (et 5.5)

J'ai mis à jour tous les plugins à la dernière version - sauf le plugin Jira qui a dû être retiré car il n'est plus compatible. Notez qu'il y a toujours une entrée dans le tableau des métriques, cela pourrait-il être problématique?

Quelqu'un peut-il s'il vous plaît me dire ce qui pourrait causer cette erreur et comment le contourner?

S'il vous plaît laissez-moi savoir si d'autres informations sont nécessaires.

Merci!

Robert

Les plugins suivants sont installés sur 5.6.2:

sonar-android-plugin-1.1.jar 
sonar-build-breaker-plugin-2.1.jar 
sonar-cobertura-plugin-1.7.jar 
sonar-csharp-plugin-5.0.jar 
sonar-findbugs-plugin-3.4.4.jar 
sonar-generic-coverage-plugin-1.2.jar 
sonar-groovy-plugin-1.4.jar 
sonar-java-plugin-4.2.jar 
sonar-javascript-plugin-2.16.0.2922.jar 
sonar-pitest-plugin-0.6.jar 
sonar-piwik-plugin-1.0.jar 
sonar-python-plugin-1.6.jar 
sonar-scm-git-plugin-1.2.jar 
sonar-scm-svn-plugin-1.3.jar 
sonar-timeline-plugin-1.5.jar 
sonar-xml-plugin-1.4.1.jar

Et ceux-ci ont été installés sur 5.3:

sonar-android-plugin-1.1.jar 
sonar-build-breaker-plugin-2.0.jar 
sonar-cobertura-plugin-1.6.3.jar 
sonar-findbugs-plugin-3.3.jar 
sonar-generic-coverage-plugin-1.2.jar 
sonar-groovy-plugin-1.3.1.jar 
sonar-java-plugin-3.14.jar 
sonar-javascript-plugin-2.13.jar 
sonar-jira-plugin-1.2.jar 
sonar-pitest-plugin-0.6.jar 
sonar-piwik-plugin-1.0.jar 
sonar-python-plugin-1.5.jar 
sonar-timeline-plugin-1.5.jar 
sonar-xml-plugin-1.4.1.jar

est ici un peu du journal indiquant la fin de la migration DB et l'exception.

2016.09.25 12:46:31 INFO web[DbMigration] == UpdateUsersExternalIdentityWhenEmpty: migrating =========================== 
2016.09.25 12:46:31 INFO web[o.s.d.v.MassUpdate] 0 users processed (0 items/sec) 
2016.09.25 12:46:31 INFO web[DbMigration] == UpdateUsersExternalIdentityWhenEmpty: migrated (0.0110s) ================== 
2016.09.25 12:46:31 INFO web[DbMigration] 
2016.09.25 12:46:32 INFO web[o.s.s.p.UpdateCenterClient] Update center: https://update.sonarsource.org/update-center.properties (no proxy) 
2016.09.25 12:46:34 INFO web[o.s.s.n.NotificationService] Notification service started (delay 60 sec.) 
2016.09.25 12:46:34 INFO web[o.s.d.c.MysqlCharsetHandler] Repair case-insensitive database columns 
2016.09.25 12:46:34 INFO web[o.s.s.s.RegisterMetrics] Register metrics 
2016.09.25 12:46:34 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Register rules 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule squid:S1318 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule squid:CycleBetweenPackages 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule findsecbugs:WEAK_MESSAGE_DIGEST 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule squid:S1724 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule squid:S1701 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule fb-contrib:SC_SUSPICIOUS_COMPARATOR_RETURN_VALUES 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule findbugs:UOE_USE_OBJECT_EQUALS 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule fb-contrib:JAO_JUNIT_ASSERTION_ODDITIES_INEXACT_DOUBLE 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule squid:S1294 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule fb-contrib:JAO_JUNIT_ASSERTION_ODDITIES_BOOLEAN_ASSERT 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule fb-contrib:SMA_STUTTERED_METHOD_ARGUMENTS 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule fb-contrib:JAO_JUNIT_ASSERTION_ODDITIES_IMPOSSIBLE_NULL 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule findbugs:SKIPPED_CLASS_TOO_BIG 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule findsecbugs:XSS_JSP_PRINT 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule findbugs:LG_LOST_LOGGER_DUE_TO_WEAK_REFERENCE 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule squid:StringEqualityComparisonCheck 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule fb-contrib:JAO_JUNIT_ASSERTION_ODDITIES_USE_ASSERT_EQUALS 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule findbugs:OBL_UNSATISFIED_OBLIGATION 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule fb-contrib:JAO_JUNIT_ASSERTION_ODDITIES_ASSERT_USED 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule findbugs:OBL_UNSATISFIED_OBLIGATION_EXCEPTION_EDGE 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule squid:LowerCaseLongSuffixCheck 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule findbugs:RV_RETURN_VALUE_IGNORED2 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule fb-contrib:JAO_JUNIT_ASSERTION_ODDITIES_ACTUAL_CONSTANT 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule squid:S1873 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule squid:UnusedProtectedMethod 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule squid:S1848 
2016.09.25 12:46:40 INFO web[o.s.s.r.RegisterRules] Disable rule findbugs:XSS_REQUEST_PARAMETER_TO_JSP_WRITER 
2016.09.25 12:46:45 INFO web[o.s.s.q.RegisterQualityProfiles] Register quality profiles 
2016.09.25 12:46:50 INFO ce[o.s.c.a.WebServerWatcherImpl] Still waiting for WebServer... 
2016.09.25 12:46:51 INFO web[o.s.s.q.RegisterQualityProfiles] Register profile {lang=cs, name=Sonar way} 
2016.09.25 12:46:53 INFO web[o.s.s.q.RegisterQualityProfiles] Set default cs profile: Sonar way 
2016.09.25 12:46:53 INFO web[o.s.s.q.RegisterQualityProfiles] Register profile {lang=java, name=FindBugs + FB-Contrib} 
2016.09.25 12:47:03 INFO web[o.s.s.q.RegisterQualityProfiles] Register profile {lang=jsp, name=FindBugs Security JSP} 
2016.09.25 12:47:03 INFO web[o.s.s.q.RegisterQualityProfiles] Set default jsp profile: FindBugs Security JSP 
2016.09.25 12:47:04 INFO web[o.s.s.s.RegisterNewMeasureFilters] Register measure filters 
2016.09.25 12:47:04 INFO web[o.s.s.s.RegisterDashboards] Register dashboards 
2016.09.25 12:47:04 INFO web[o.s.s.s.RegisterPermissionTemplates] Register permission templates 
2016.09.25 12:47:04 INFO web[o.s.s.s.RenameDeprecatedPropertyKeys] Rename deprecated property keys 
2016.09.25 12:47:04 INFO web[o.s.s.p.MasterServletFilter] Initializing servlet filter [email protected] [pattern=/sessions/init/*] 
2016.09.25 12:47:04 INFO web[o.s.s.p.MasterServletFilter] Initializing servlet filter [email protected] [pattern=/oauth2/callback/*] 
2016.09.25 12:47:04 INFO web[o.s.s.e.IndexerStartupTask] Index activities 
2016.09.25 12:47:05 INFO web[o.s.s.e.IndexerStartupTask] Index issues 
2016.09.25 12:47:07 INFO web[o.s.s.e.IndexerStartupTask] Index tests 
2016.09.25 12:47:07 INFO web[o.s.s.d.m.PlatformDatabaseMigration] DB migration failed | time=45804ms 
2016.09.25 12:47:07 ERROR web[o.s.s.d.m.PlatformDatabaseMigration] DB Migration or container restart failed. Process ended with an exception 
java.lang.RuntimeException: java.util.concurrent.ExecutionException: java.lang.IllegalStateException: Fail to decompress and deserialize source data 
    at com.google.common.base.Throwables.propagate(Throwables.java:160) ~[guava-17.0.jar:na] 
    at org.sonar.server.es.BaseIndexer.index(BaseIndexer.java:82) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.es.BaseIndexer.index(BaseIndexer.java:88) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.es.IndexerStartupTask.execute(IndexerStartupTask.java:71) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.platform.platformlevel.PlatformLevelStartup$1.doPrivileged(PlatformLevelStartup.java:81) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.user.DoPrivileged.execute(DoPrivileged.java:44) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.platform.platformlevel.PlatformLevelStartup.start(PlatformLevelStartup.java:77) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.platform.Platform.executeStartupTasks(Platform.java:201) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.platform.Platform.doStart(Platform.java:114) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.platform.Platform.doStart(Platform.java:99) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.db.migrations.PlatformDatabaseMigration.doRestartContainer(PlatformDatabaseMigration.java:138) [sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.db.migrations.PlatformDatabaseMigration.doDatabaseMigration(PlatformDatabaseMigration.java:114) [sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.db.migrations.PlatformDatabaseMigration.access$000(PlatformDatabaseMigration.java:37) [sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.db.migrations.PlatformDatabaseMigration$1.run(PlatformDatabaseMigration.java:101) [sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1142) [na:1.8.0_92] 
    at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:617) [na:1.8.0_92] 
    at java.lang.Thread.run(Thread.java:745) [na:1.8.0_92] 
Caused by: java.util.concurrent.ExecutionException: java.lang.IllegalStateException: Fail to decompress and deserialize source data 
    at java.util.concurrent.FutureTask.report(FutureTask.java:122) ~[na:1.8.0_92] 
    at java.util.concurrent.FutureTask.get(FutureTask.java:192) ~[na:1.8.0_92] 
    at com.google.common.util.concurrent.Uninterruptibles.getUninterruptibly(Uninterruptibles.java:135) ~[guava-17.0.jar:na] 
    at org.sonar.server.es.BaseIndexer.index(BaseIndexer.java:80) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    ... 15 common frames omitted 
Caused by: java.lang.IllegalStateException: Fail to decompress and deserialize source data 
    at org.sonar.db.source.FileSourceDto.decodeTestData(FileSourceDto.java:167) ~[sonar-db-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.test.index.TestResultSetIterator.read(TestResultSetIterator.java:79) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.test.index.TestResultSetIterator.read(TestResultSetIterator.java:60) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.db.ResultSetIterator.next(ResultSetIterator.java:82) ~[sonar-db-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.test.index.TestIndexer.doIndex(TestIndexer.java:93) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.test.index.TestIndexer.doIndex(TestIndexer.java:80) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.test.index.TestIndexer.doIndex(TestIndexer.java:70) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.es.BaseIndexer$2.index(BaseIndexer.java:91) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.server.es.BaseIndexer$1.run(BaseIndexer.java:73) ~[sonar-server-5.6.2.jar:na] 
    at java.util.concurrent.Executors$RunnableAdapter.call(Executors.java:511) ~[na:1.8.0_92] 
    at java.util.concurrent.FutureTask.run(FutureTask.java:266) ~[na:1.8.0_92] 
    ... 3 common frames omitted 
Caused by: com.google.protobuf.InvalidProtocolBufferException: Stream is corrupted 
    at com.google.protobuf.AbstractParser.parsePartialDelimitedFrom(AbstractParser.java:230) ~[protobuf-java-3.0.0-beta-2.jar:na] 
    at com.google.protobuf.AbstractParser.parseDelimitedFrom(AbstractParser.java:246) ~[protobuf-java-3.0.0-beta-2.jar:na] 
    at com.google.protobuf.AbstractParser.parseDelimitedFrom(AbstractParser.java:251) ~[protobuf-java-3.0.0-beta-2.jar:na] 
    at com.google.protobuf.AbstractParser.parseDelimitedFrom(AbstractParser.java:49) ~[protobuf-java-3.0.0-beta-2.jar:na] 
    at org.sonar.db.protobuf.DbFileSources$Test.parseDelimitedFrom(DbFileSources.java:4267) ~[sonar-db-5.6.2.jar:na] 
    at org.sonar.db.source.FileSourceDto.decodeTestData(FileSourceDto.java:160) ~[sonar-db-5.6.2.jar:na] 
    ... 13 common frames omitted

Source

2016-09-25 Robert Smith

Répondre

0

Je n'ai aucun indice pour le moment. Pendant ce temps, le ticket https://jira.sonarsource.com/browse/SONAR-8178 a été créé pour la version 5.6.3.

Source

2016-09-26 07:53:58

+1

Merci, Simon! Après avoir lu votre ticket, j'ai été capable de construire ma propre version SNAPSHOT du pot du serveur qui avale cette exception. Cela m'a permis de faire la mise à niveau pour l'équipe qui en avait vraiment besoin. Je vais attendre de voir comment 5.6.3 se forme avant de déplacer les autres équipes. Je n'ai pas suivi le code pour essayer de fournir des informations significatives sur ce qui, dans les données, était réellement à l'origine du problème. Merci encore :-) –

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