Dendrogramme en R: comment accrocher correctement les branches (après avoir colorié les étiquettes)?

Question

Je suis passé par d'autres questions posées sur ce sujet et j'ai réussi à obtenir "partiellement" ce dont j'avais besoin. Je veux que les feuilles de mon dendrogramme soient colorées. Chaque congé représente un marché et j'ai une autre colonne dans mon DF qui indique quel type de marché il est via les codes de couleur "Rouge", "Jaune" ou "Vert" (qui ont été codés comme des nombres: "1", "2" "3"). Chaque marché a un code de couleur. Je veux que les étiquettes soient les marchés eux-mêmes, mais la couleur des étiquettes doit être basée sur des codes de couleur. Mon problème est que lorsque je trace cela, les étiquettes sont codées, mais l'arbre est vraiment allongé. C'est tellement long que les étiquettes aussi sont coupées. Que fais-je?

Answer 1

je devais « accrocher » les étiquettes plutôt que de les tracer tous sur une hauteur unique. A la suite a fait l'affaire:

dend %>% set("leaves_pch", 19) %>% set("leaves_cex", 2) %>% 
set("leaves_col", 2) %>%  # adjust the leaves 
hang.dendrogram(dend, hang_height = 0.01) %>% # hang the leaves 
plot(main = "Hanging a tree") 

https://cran.r-project.org/web/packages/dendextend/vignettes/introduction.html