MPI sur le cluster PBS Hello World

Question

J'utilise mpiexec pour exécuter un couple d'exécutables Hello World. Ils s'exécutent chacun, mais le nombre de processus est toujours 1 où il semble qu'il devrait y avoir 4 processus. Est-ce que quelqu'un comprend pourquoi? Aussi je ne suis pas sûr pourquoi stty me donne un argument invalide. Merci!

est ici la sortie:

/bin/stty: standard input: invalid argument 
    Hello world from process 0 of 1 
    Hello world from process 0 of 1 
    Hello world from process 0 of 1 
    Hello world from process 0 of 1 

Voici le fichier c:

#include <stdio.h> 
#include <mpi.h> 

int main(int argc, char *argv[]) 
{ 
    int rank, size; 
    MPI_Init (&argc, &argv); 
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank); 
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size); 
    printf("Hello world from process %d of %d\n", rank, size); 
    fflush(stdout); 
    MPI_Finalize(); 
    return 0; 
} 

Voici le script de soumission:

#!/bin/bash 

#PBS -N helloWorld 
#PBS -l select=4:ncpus=2 
#PBS -j oe 
#PBS -o output 
#PBS -l walltime=3:00 
cd $PBS_O_WORKDIR 


mpiexec ./helloWorld 

Answer 1

Steven:

ci-dessus devrait marcher; il ressemble à quelque chose le long de la ligne (PBS < -> bibliothèque MPI-> mpiexec) est mal configuré.

La première supposition la plus évidente - est le mpiexec le même programme de lancement mpi qui correspond à la bibliothèque que vous avez compilé? Si vous faites un which mpiexec dans votre script, obtenez-vous quelque chose qui correspond au which mpicc lorsque vous compilez le programme? Avez-vous besoin de faire quelque chose comme un "module load [mpi package]" avant de compiler?

De même, votre système mpiexec est-il compatible PBS? Sinon, vous devrez peut-être spécifier un fichier hôte ($ {PBS_NODEFILE}) et le nombre de processeurs. Quels sont les MPI que vous utilisez, et sur quel système travaillez-vous? Est-ce un système disponible publiquement avec une documentation que nous pouvons regarder?