Comment puis-je utiliser le format mmCIF à la place de PDB dans BioJava?

Question

J'ai un petit problème ...

Je sais que pour télécharger une structure PDB en utilisant BioJava je devrais utiliser

Structure s = StructureIO.getStructure("code"); 

Ce que je dois faire pour utiliser au lieu fichier mmCIF?

Answer 1

Si vous utilisez le dernier BioJava, la valeur par défaut est déjà d'utiliser mmcif. Vous pouvez le configurer dans la classe AtomCache (et définir un cache personnalisé dans StructureIO)