Il semble que ne peut pas prédire les probabilités conditionnelles de l'état suivant après des contextes qui consistent en un seul état, par ex. EX-EX
Prédiction de probabilités conditionnelles basées sur des contextes avec seulement 1 état
Tenir compte de ce code:
# Load libraries
library(RCurl)
library(TraMineR)
library(PST)
# Get data
x <- getURL("https://gist.githubusercontent.com/aronlindberg/08228977353bf6dc2edb3ec121f54a29/raw/c2539d06771317c5f4c8d3a2052a73fc485a09c6/challenge_level.csv")
data <- read.csv(text = x)
# Load and transform data
data <- read.table("thread_level.csv", sep = ",", header = F, stringsAsFactors = F)
# Create sequence object
data.seq <- seqdef(data[2:nrow(data),2:ncol(data)], missing = NA, right= NA, nr = "*")
# Make a tree
S1 <- pstree(data.seq, ymin = 0.05, L = 6, lik = TRUE, with.missing = TRUE)
# Mine the context
context <- seqdef("EX-EX")
p_context <- predict(S1.p1, context, decomp = F, output = "prob")
La ligne context <- seqdef("EX-EX")
rendements:
[>] 1 distinct states appear in the data:
1 = EX
Error:
[!] alphabet contains only one state
qui signifie que predict()
ne peut être exécutée.
Comment est-ce que je peux prédire les probabilités conditionnelles de l'état suivant basé sur des contextes qui ont seulement 1 état, qui peut être répété plusieurs fois?
Cela fonctionne pour les contextes qui répètent le même marqueur, par ex. 'EX-EX'. Cependant, les contextes qui ont 1 marqueur sont longs, par ex. 'EX' ne sont toujours pas calculés, mais ici le problème semble être dans' predict() 'pas dans' seqdef() ' – histelheim
Pour' EX', qui n'est pas vraiment une séquence, sa probabilité est simplement sa probabilité d'occurrence dans les données. Vous l'obtenez par exemple comme 'seqstatf (data.seq) [" EX ", 2]/100'. – Gilbert