en boucle à travers une colonne en R

Question

J'utilise le package R's stats et souhaite par la boucle à travers column[x] dans all the rows of a dataframe, opérer sur les données dans each cell dans la colonne avec une fonction et de transmettre le résultat à une nouvelle colonne (avec la calculated result en le new column aligné avec les données column[x])

J'ai deux problèmes:

1. Je ne peux pas faire fonctionner
2. looping semble être découragé dans le R articles J'ai lu. Y a-t-il une approche alternative et si non, quelqu'un a-t-il un exemple de la façon de réaliser la boucle?

Answer 1

Sans aucun exemple, il est difficile de savoir comment répondre. Le cas de base de ce que vous décrivez, cependant, est la suivante:

#Just a very simple data frame 
dat <- data.frame(x = c(1, 2, 3)) 
#Compute the squared value of each value in x 
dat$y <- dat$x^2 
#See the resultant data.frame, now with column y 
dat 

Lorsque vous dites R au carré un vecteur (ou la structure vecteur semblable, comme dat $ x), il sait carré chaque valeur séparément . Vous n'avez pas besoin de boucler explicitement ces valeurs la plupart du temps - bien que, comme le remarque Dirk, vous ne devriez vous soucier de l'optimisation de vos boucles que si elles vous causent des problèmes. Cela dit, je préfère certainement lire et écrire

dat$y <- dat$x^2 

à:

for(i in 1:length(dat$x)){ 
    dat$y[i] <- dat$x[i]^2 
} 

... si possible.

Answer 2

si parse.smiles() est une fonction que vous souhaitez appliquer à tous l'entrée d'un vecteur « VEC », vous pouvez utiliser:

lapply(1:length(vec),parse.smiles(vec[i])) 

Answer 3

La seule raison looping est découragé est qu'il est lent. R est conçu pour fonctionner sur des vecteurs à la fois et a beaucoup de fonctions pour y parvenir. L'ensemble s'applique famille, ainsi que des fonctions comme Vectorize pour aider. Donc, l'idiome est que si vous utilisez pour les boucles que vous ne pensez pas en R, mais parfois pour les boucles sont tout simplement appropriés. Pour cela dans le mode de pensée R, vectorisez votre fonction, si elle n'est pas déjà vectorisée (voir la fonction Vectoriser), puis appelez cette fonction avec la colonne entière comme argument et affectez-la à la nouvelle colonne.

f<-Vectorize(function(x,...),'x') 
data$newcolumn<-f(data[,1]) 

La famille appliquer (appliquer, sapply, lapply, mapply, tapply) sont également des solutions de rechange. La plupart des fonctions R natives sont déjà vectorisées, mais soyez prudent lorsque vous passez des arguments supplémentaires qui sont censés être interprétés comme des vecteurs.