%% La balise magique de cellule ne fonctionne pas dans le cahier de Jupyter?

Question

Je suis nouveau sur le portable de Jupyter et j'essaye d'en créer un avec Python et R, en utilisant rpy2. J'ai la ligne

%%R -i df 

qui me donne la SyntaxError d'erreur: syntaxe non valide

Cependant quand je viens d'utiliser un%, comme

%R require(ggplot2) 

cela fonctionne très bien. Comment puis-je résoudre ce problème? J'utilise Python 2.7.

Answer 1

% le préfixe est pour une magie de ligne, alors que le préfixe %% est pour une magie de cellule.

%%R # <-- must be the only instruction on this line 
{body of cell in R code} 

alors:

%R {one line of R code} 

Je n'ai pas R installé, mais je pense que vous avez peut-être voulu appeler une commande bash sur R; dans ce cas, utilisez ! pour appeler la commande:

!R -i df 

par exemple, si je tape !python -i, j'obtenir des informations sur mon environnement python actuel:

Python 3.6.2 |Anaconda custom (x86_64)| (default, Jul 20 2017, 13:14:59) 
[GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 6.0 (clang-600.0.57)] on darwin 
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. 
>>> 

Answer 2

C'est une vieille question, mais je courir dans le même problème aujourd'hui. La réponse de Reblochon Masque ne s'applique plus aujourd'hui. %%R -i df au milieu d'une cellule jette invalid syntax. Également !R -i df jette WARNING: unknown option '-i' ARGUMENT 'df' __ignored__.

Voici ce que je dois faire à la cellule magique R pour travailler:

1. suivre this instruction installer R paquets RJSONIO et httr (nom du package est en effet minuscule) et Python package rpy2. Aucune autre configuration n'est nécessaire.

2. mettez simplement une ligne %load_ext rpy2.ipython dans une cellule pour appeler rpy2.

3. %%R doit être au tout début d'une cellule, donc je mets cette ligne dans la cellule suivante.

4. le corps de la cellule ne peut pas être vide après %%R.

5. %%R -i df fonctionne comme prévu.