2017-08-23 1 views
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Lors du traçage d'un phylogénétique à l'aide de ape, les étiquettes de pointe ne sont pas entièrement alignées. Voici mon code et une image pour montrer ce numéro:aligner les étiquettes de branches du tracé plylo r

par(lty= 1) 
ape::plot.phylo(phylotree, align.tip.label= T, label.offset = 1, no.margin = T, cex= .55) 

enter image description here

alignement de pointe peut être contrôlé en utilisant l'argument align.tip.label= TRUE. Cependant, les extensions d'astuce sont dessinées en pointillés même après la définition de par (lty = 1). Y a-t-il un moyen d'obtenir des lignes continues? Mon phylot: tree

En aparté. La taille de la police semble perturber la propagation parfaite des branches. Peut-il être augmenté sans encombrer les étiquettes?

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Je pastebinned mon phylotree –

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Téléchargez my.plot.phylo.rhere et enregistrez-le dans votre répertoire de travail.
Ensuite, exécutez le code suivant:

source("my.plot.phylo.r") 
my.plot.phylo(phylotree, align.tip.label= T, label.offset = 1, 
       no.margin = T, cex= .8, font=10) 

enter image description here